O Departamento constitúese no ano 1986; nun principio a actividade dos profesores centrouse fundamentalmente no deseño, desenrolo e avaliación de materiais curriculais para a o ensinanza e o aprendizaxe das ciencias , a través de dous proxectos:

• O proxecto AcAb para a ensinanza-aprendizaxe das ciencias, no nivel de 12-16 anos, direixido por Eugenio García-Rodeja e financiado pola Xunta de Galicia e a Universidade de Santiago de Compostela.
  
• O proxecto ACES, deseño de materais curriculais para a educación secundaria obrigatoria coordinado por Francisco Lorenzo Barral, María Pilar Jiménez Aleixandre e Luis Otero Rodríguez. Financiado por o CIDE.

Na Actualidade, os profesores do Área de Didáctica das Ciencias Naturais centras a súa actividade na análise dos procesos de comunicación e argumentación na aula a través do proxecto RODA direxido por María Pilar Jiménez Aleixandre e financiado por DGESIC.